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物種特異性小RNA位點在真核生物基因組中廣泛存在，但它們在譜系特異性適應、表型多樣化和物種形成中的作用尚不清楚。本研究針對三種不同授粉特性的猴面花物種，直接摒棄基于M. lewisii 與M. cardinalis 構建雜交群體發(fā)掘YUP位點的傳統方法，巧妙引入自花傳粉的M. parishii，將這三個物種經一系列雜交、回交和自交，并適時結合表型和基因型選擇，成功獲得了Mlew_yupC/CpelanP/P 近等基因系。再通過對相關材料進行基因組測序組裝、共線性分析、功能驗證和遺傳進化分析等確定了YUP候選基因。研究顯示，猴面花(Mimulus)的這個經典物種形成位點YELLOW UPPER (YUP )為物種特異性小RNA位點它包含一個反向重復區(qū)域，可以產生階段性的小干擾RNAs (siRNAs)。其中一種siRNA 通過抑制類胡蘿卜素生物合成和有色體發(fā)育的主要調節(jié)因子來調控花的色素沉著。YUP與另外兩個基因一起在大約五百萬年前起源于Mimulus 一個亞分支的共同祖先，作為一個“超級位點”控制花朵顏色，并在后代物種的花色多樣化和傳粉媒介介導的生殖隔離中發(fā)揮了關鍵作用。這些結果證明了物種特異性非編碼基因在后續(xù)生物進化中的重要性。
研究結果以Taxon-specific, phased siRNAs underlie a speciation locus in monkeyflowers為題，于2月10日在《科學》(Science)雜志以封面文章形式在線發(fā)表。中國科學院西北高原生物研究所（中國科學院高原生物適應與進化重點實驗室、青海省作物分子育種重點實驗室）副研究員陳文杰為該論文的第二作者。
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